Poco antes de el estreno del anime de Hetalia en Japón se desato un conflicto con Corea, que propisio que un importante numero de coreanos se pronunciaran en contra de dicho anime. Entre los motivos que se presentababan eran algunos puntos que reflejaba un estereotipo equivocado de Corea por medio del personaje que representaba dicho país, el hecho de que este llamara a China "Heramano Mayor" pero sobre todo el incidente de "Dokdo/Takeshima". Todo comenzo con la escena en donde Korea agarra el pecho a Japon, (rarisimo este tipo de "Contacto" en un anime Shonnen-Ai). Escena que es importante mencionar solo aparecio en el manga y no se presento en el anime. Esto fue interpretado por los Coreanos como una referencia al territorio en disputa de"Rocas de Liancourt", Dokdo (Para los Coreanos) /Takeshima (Para los Japones) un par de islas de roca volcanica, al sur de Japon, que actualmente se encuentran bajo dominio coreano y que Japon reclama como de su propiedad. Fue entonces que diversos grupos coreanos llevaron acabo una fuerte campaña en contra de Hetalia y recolectaron mas 16 000 firmas con el fin de cancelar dicha serie.

Poco tiempo despues Kid Station, cadena que trasmitiria el anime en la televisión japonesa, apartir de enero de 2009, cancelo el proyecto. En diversas declaraciones que emitio sobre el asunto afirmó que el personaje de Corea no aparece en el anime y que era "consciente de las críticas que se habían hecho fuera del país", y citó que "diversas circunstancias" estaban detrás de la decisión de cancelar la emisión del anime, sin embargo, no proporcionó información adicional sobre la naturaleza de estas circunstancias. La transmisión vía Internet y por teléfono móvil no se vieron afectadas.

No conformes con esta resolución, diversos grupos intentaron parar toda distribución de la serie sin importar el medio de la misma e inclusive en los caso mas extremos, pedian que el Primer Ministro de Corea se Pronunciara en contra de Hetalia. El asunto se estanco y no se ha llegado a nuevas resoluciones.